合成生物學的一個重要目標是,，以可持續(xù)方式,，利用簡單,、廉價,、可再生的原始材料,，生產有價值的化學產品,。類似于JBEI研發(fā)的計算機輔助模型和仿真是合成生物學實現(xiàn)目標的基本條件之一,。但迄今為止，這種生物學工具仍然受到局限,。

美國能源部聯(lián)合生物研究所（JBEI）的研究人員研究結果顯示,，在計算機輔助設計RNA分子工程系統(tǒng)方面取得進展，這也許將引起一系列產業(yè)發(fā)生突破,，其中包括發(fā)展更廉價的先進生物燃料生產,。科學家將利用這些新“RNA裝置”調整微生物細胞中的基因表達,，這將有助于科學家研發(fā)新的大腸桿菌菌株,。這種菌株能更好地消化柳枝稷生物質，將糖分轉化為三種運輸燃料：汽油,、柴油和噴氣燃料,。

大腸桿菌設計上的突破有助于利用柳枝稷和其他非食用生物質植物生產更廉價的、能夠替代汽油的先進生物燃料。JBEI 的研究聚焦于研發(fā)先進生物燃料,，但研究人員認為他們的研究概念也許能幫助其他研究人員研發(fā)出其他需求產品,，包括可生物降解塑料和用于治療的藥物。

生物系統(tǒng)極其復雜,，這使得微生物工程系統(tǒng)難以生產出預期數(shù)量的需求產品,。該研究首次以一種可預見的方式建立和調整RNA系統(tǒng)。值得一提的是,，研究人員關注的RNA序列設計方法,，能折疊成復雜的三維形象：核酶和適體酶。利用JBEI創(chuàng)建的計算機輔助模型和仿真,，研究人員研發(fā)出復雜的基于RNA的控制系統(tǒng),，能規(guī)劃大量基因。在微生物中,，指令被傳送給細胞,，經過RNA基控制系統(tǒng)處理，有助于形成期望產品,。